Структура МБОУ «СШ №42» включает совокупность подразделений, обеспечивающих осуществление образовательной деятельности с учетом уровня, вида и направленности реализуемых образовательных программ и представляет собой внутреннее устройство школы. Структурные подразделения действуют на основании устава образовательного учреждения и положения о соответствующем структурном подразделении, утвержденного в порядке, установленном уставом школы. Взаимодействие структурных подразделений, оперативность принятия решений поддерживается «Информационно - техническим отделом» на основе реализации проекта «Использование локальной сети для оптимизации управления процессом образования».
В соответствии с уставом муниципального бюджетного общеобразовательного учреждения "Средняя школа № 42" ,филиалы и представительства отсутствуют.